Colocar um tema diferente para cada curso no Moodle

1 - Entre em seu moodle como administrador
2 - Iremos habilitar a Personalização do Tema para Curso, logado como administrador procure por:

A) Adminsitração do site, clique em Aparência, em seguida Temas e clique em Configurações de tema.

Abrirá uma tela semelhante a esta:

B) Após ativado clique em Salvar Mudanças

C) Depois de salvo procure por, Administração do site - cursos - Acrescentar/Modificar cursos.
Abrirá a relação de categorias que você tem em seu moodle, selecione a categoria que deseja, em seguida clique sob configurações do curso, representada por uma engrenagem. Veja Imagem

D) Em configurações procure por Aparência e clique. Abrirá uma tela semelhante a esta. Veja imagem

E) A opção forçar tema serve justamente para que o tema, escolhido para este curso, seja forçado a aparecer quando o usuário entrar nele. Basta escolher o tema desejado e salvar mudanças.

Para saber como instalar um tema veja o artigo https://www.moodlelivre.com.br/tutoriais-e-dicas-moodle/como-instalar-um-tema-template-no-moodle